中心负责创新港全面后勤保障服务工作，包括后勤保障服务的提供，对提供后勤保障服务提供单位进行管理、监督和考核。综合事务办公室主要负责中心公文管理，宣传、招租、采购、合同、固定资产统筹等，负责创新港商业配套服务管理、新港小巴管理服务等；能源设备办公室负责创新港物业管理服务（包括保洁、宿管、会服、安保、工程维修、绿化养护等），水、电、冷、暖运行管理服务，通勤班车管理服务，充电桩管理服务等；饮食管理办公室负责创新港食堂餐饮管理服务。